Knížák byl v devadesátých letech rektorem Akademie výtvarných umění v Praze, od roku 1999 do května 2011 pak byl ředitelem Národní galerie v Praze. Mezi lety 2001 a 2003 byl také členem Rady České televize. Kromě Česka učil i na zahraničních vysokých školách, v USA, Německu a Švýcarsku. Byl také nositelem Medaile Za zásluhy prvního stupně, kterou mu udělil Václav Klaus.
Milan Knížák patřil k nejvýraznějším i nejrebelštějším zjevům české nezávislé kultury v období komunistické totality. Už od šedesátých let dráždil státní moc svým konceptuálním uměním a prvotními akcemi v ulicích Prahy, v nichž propojoval výtvarné umění, hudbu a divadlo do podob takzvaných happeningů. Založením volného uskupení Aktual v roce 1964 vytvořil jakýsi protipól k oficiálně schválené tvorbě a stal se průkopníkem českého undergroundu. Režim reagoval neustálým dohledem, výslechy a cenzurou, což Knížáka paradoxně ještě více utvrdilo v jeho odporu vůči konformitě a diktátu socialistického realismu.

Procházet se komunistickým Československem s neobvyklým účesem, osobitým oblečením nebo organizovat pouliční akce znamenalo pro Knížáka stálé riziko. Státní bezpečnost ho považovala za protistátního živla a asociála, což vedlo k tomu, že byl třikrát soudně trestán a strávil téměř tři roky ve vězení. V roce 1968 sice získal možnost odcestovat do Spojených států na pozvání mezinárodního hnutí Fluxus, jehož se stal vedoucím představitelem pro východní Evropu, avšak po návratu do vlasti v době nastupující normalizace se dočkal jen přísné izolace. Byla mu odebrána možnost oficiálně vystavovat, neměl pas a živil se všemožnými pomocnými pracemi, od úklidu až po restaurování památek, přičemž jeho díla kolovala dál převážně v samizdatu a v zahraničí.



O Knížákovi jsem slyšel, ale popravdě, vlastně si nedokážu vzpomenou na nic podstatného, co udělal. Pokud ale čtu o „experimentálních destrukcích gramofonových desek“ nebo o tom že provokoval účesem, tak vlastně ani nemám zájem si o něm něco dalšího zjišťovat.
Pane jo! Podle toho textu by jeden řekl, že Knížák byl největší kulturní osobností od dob Kosmase. „Průkopníkem českého undergroundu“? S „kapelou“ Aktual? Jako fakt? Já si třeba pamatuju jeho billboardy s houbami, jež byly opravdu více happeningem než uměním:-D